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SARS-CoV-2 phylogeny

Built with neherlab/ncov-simple. Maintained by Cornelius Roemer, Richard Neher and Tanja Stadler. Data updated 2023-05-22. Enabled by data from

Showing 511 of 2388 genomes sampled between Mar 2020 and May 2023.Filtered to

Switzerland (511)

Phylogeny

Geography

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This phylogeny shows evolutionary relationships of SARS-CoV-2 viruses from the ongoing novel coronavirus COVID-19 pandemic with a particular focus on Switzerland. We aim to include as many genomes from Switzerland as possible. In addition, we include virus genomes from other European countries and to lesser extent from the rest of the world to provide phylogenetic context. This context is important to understand how different outbreaks are connected and how the virus might have spread around the globe. We note, however, that direct linkage on the tree does not necessarily mean there exists a direct epidemiological link. Sampling of viral genomes is very incomplete and heterogeneous and mutations occur on average only every two weeks. Extended periods without mutations are therefore not uncommon and direct links or directionality cannot be inferred from the tree alone.

The data from Switzerland was contributed by the following groups:

Computational Evolution group at D-BSSE of the ETHZ in Basel and the SIB Swiss Institute of Bioinformatics. Samples were provided by Viollier AG, sequenced on Illumina technology by the Genomic Facility Basel (lead C. Beisel), and processed with the SIB Resource V-Pipe viral assembly pipeline (Ivan Topolsky, Pedro Ferreira, Philipp Jablonski, Susana Posada-Céspedes, Niko Beerenwinkel).
University Hospital Basel, Clinical Virology and Clinical Microbiology.
Laboratory of Virology (University Hospitals of Geneva (HUG)). Samples were collected from different cantons in Switzerland, sequenced on Illumina NovaSeq (H2030 Genome Center) or HiSeq4000 (iGE3 Genomics Platform from the University of Geneva) instruments and processes by the Laboratory of Virology from HUG (Florian Laubscher, Samuel Cordey, Ana Rita Goncalves and Laurent Kaiser) and/or the H2030 Genome Center (Lorenzo Cerutti, Henri Pegeot, Melyssa Elies, Deborah Penet, Keith Harshman, Ioannis Xenarios, and Emmanouil Dermitzakis).
Institute of Medical Virology at University of Zurich. Samples were provided by University Hospital Zurich, Triemli Hospital Zurich and Klinik Hirslanden Zurich, sequenced on Illumina technology and processed with VirMet viral metagenomic pipeline (Stefan Schmutz, Maryam Zaheri, Verena Kufner, Gabriela Ziltener, Jürg Böni, Michael Huber, Alexandra Trkola)

The analysis is maintained by

Cornelius Roemer at Biozentrum of the University of Basel and the Swiss Institute of Bioinformatics
Richard Neher at Biozentrum of the University of Basel and the Swiss Institute of Bioinformatics
Sarah Nadeau at ETH Zürich and the Swiss Institute of Bioinformatics
Tanja Stadler at ETH Zürich and the Swiss Institute of Bioinformatics

All data we use (Swiss and international) are deposited in GISAID. We gratefully acknowledge the authors, originating and submitting laboratories of the genetic sequence and metadata made available through GISAID on which this research is based. A full listing of all originating and submitting laboratories is available below. An attribution table is available by clicking on "Download Data" at the bottom of the page and then clicking on "Strain Metadata" in the resulting dialog box.

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A (4)

A.2 (2)

A.2.5 (2)

A.23.1 (1)

AU.2 (1)

AY.1 (1)

AY.100 (1)

AY.102 (2)

AY.103 (2)

AY.106 (1)

AY.112 (3)

AY.113 (2)

AY.119 (1)

AY.119.2 (1)

AY.121 (2)

AY.122 (20)

AY.124 (3)

AY.124.1 (1)

AY.125 (1)

AY.127 (1)

AY.129 (1)

AY.13 (1)

AY.20 (1)

AY.23 (4)

AY.24.1 (1)

AY.26 (1)

AY.27 (1)

AY.3 (1)

AY.30 (1)

AY.34 (3)

AY.34.1 (3)

AY.34.2 (1)

AY.36 (1)

AY.38 (1)

AY.39 (1)

AY.39.1.1 (1)

AY.4 (9)

AY.4.2 (3)

AY.41 (1)

AY.43 (25)

AY.43.4 (1)

AY.43.8 (2)

AY.44 (1)

AY.45 (3)

AY.46.2 (1)

AY.46.6 (1)

AY.5 (3)

AY.50 (1)

AY.54 (1)

AY.57 (1)

AY.7.1 (1)

AY.70 (3)

AY.75 (3)

AY.78 (1)

AY.88 (1)

AY.9.2 (3)

AY.91 (1)

AY.95 (2)

AY.98.1 (3)

AZ.2 (1)

AZ.5 (1)

B (5)

B.1 (47)

B.1.1 (29)

B.1.1.1 (3)

B.1.1.141 (1)

B.1.1.153 (1)

B.1.1.163 (1)

B.1.1.216 (1)

B.1.1.219 (1)

B.1.1.232 (1)

B.1.1.25 (1)

B.1.1.277 (3)

B.1.1.298 (1)

B.1.1.312 (1)

B.1.1.317 (1)

B.1.1.318 (2)

B.1.1.328 (1)

B.1.1.33 (2)

B.1.1.348 (1)

B.1.1.409 (1)

B.1.1.420 (1)

B.1.1.458 (1)

B.1.1.523 (1)

B.1.1.525 (1)

B.1.1.7 (65)

B.1.1.70 (2)

B.1.1.91 (1)

B.1.111 (2)

B.1.147 (2)

B.1.159 (1)

B.1.160 (7)

B.1.160.17 (1)

B.1.177 (8)

B.1.177.54 (1)

B.1.177.56 (1)

B.1.2 (3)

B.1.22 (1)

B.1.221 (1)

B.1.223 (1)

B.1.239 (1)

B.1.258 (4)

B.1.258.17 (2)

B.1.258.2 (1)

B.1.258.3 (1)

B.1.281 (1)

B.1.310 (1)

B.1.351 (5)

B.1.351.2 (3)

B.1.351.5 (3)

B.1.36 (5)

B.1.36.16 (1)

B.1.411 (1)

B.1.416 (1)

B.1.418 (1)

B.1.428 (1)

B.1.429 (1)

B.1.466.2 (2)

B.1.480 (1)

B.1.497 (4)

B.1.499 (2)

B.1.524 (1)

B.1.525 (7)

B.1.562 (1)

B.1.575 (1)

B.1.600 (3)

B.1.617.2 (15)

B.1.621 (2)

B.1.626 (1)

B.1.637 (1)

B.1.83 (1)

B.1.9.5 (1)

B.1.96 (1)

B.10 (1)

B.12 (1)

B.4 (1)

B.4.2 (1)

B.41 (1)

B.6 (1)

B.6.6 (2)

B.6.8 (1)

BA.1 (6)

BA.1.1 (35)

BA.1.1.1 (3)

BA.1.15 (3)

BA.1.15.1 (1)

BA.1.17 (4)

BA.1.17.2 (2)

BA.1.18 (4)

BA.1.21 (1)

BA.2 (52)

BA.2.12.1 (6)

BA.2.2 (1)

BA.2.2.1 (1)

BA.2.3 (6)

BA.2.3.16 (1)

BA.2.36 (1)

BA.2.38 (1)

BA.2.5 (1)

BA.2.56 (1)

BA.2.75.2 (1)

BA.2.75.5 (1)

BA.2.9 (15)

BA.4 (4)

BA.4.1 (6)

BA.4.1.8 (2)

BA.4.6 (1)

BA.5 (9)

BA.5.1 (19)

BA.5.1.1 (2)

BA.5.1.10 (1)

BA.5.1.18 (1)

BA.5.1.2 (1)

BA.5.1.21 (1)

BA.5.1.23 (4)

BA.5.1.30 (2)

BA.5.1.4 (1)

BA.5.1.5 (2)

BA.5.11 (1)

BA.5.12 (2)

BA.5.2 (27)

BA.5.2.1 (22)

BA.5.2.13 (1)

BA.5.2.18 (1)

BA.5.2.20 (1)

BA.5.2.25 (1)

BA.5.2.26 (2)

BA.5.2.32 (1)

BA.5.2.34 (2)

BA.5.2.46 (1)

BA.5.2.47 (1)

BA.5.2.48 (4)

BA.5.2.6 (4)

BA.5.2.61 (1)

BA.5.3.1 (3)

BA.5.3.5 (1)

BA.5.5 (2)

BA.5.5.2 (1)

BA.5.6 (3)

BA.5.9 (1)

BE.1 (1)

BE.1.1 (5)

BE.1.1.2 (1)

BE.10 (1)

BF.1 (2)

BF.11 (1)

BF.11.2 (1)

BF.11.3 (2)

BF.14 (5)

BF.21 (1)

BF.28 (2)

BF.37 (1)

BF.39 (1)

BF.4 (1)

BF.5 (8)

BF.7 (11)

BF.7.14 (2)

BF.7.23 (3)

BF.7.4 (2)

BF.7.4.1 (1)

BF.7.5 (3)

BF.7.6 (2)

BL.1 (1)

BM.1.1.3 (2)

BM.4 (1)

BM.4.1 (1)

BN.1 (2)

BN.1.1.1 (2)

BN.1.2 (9)

BN.1.3 (11)

BN.1.3.1 (8)

BN.1.3.3 (2)

BN.1.4 (1)

BN.1.4.3 (1)

BN.1.5 (4)

BN.1.7 (1)

BN.1.9 (1)

BN.3.1 (1)

BQ.1 (8)

BQ.1.1 (56)

BQ.1.1.1 (2)

BQ.1.1.11 (3)

BQ.1.1.13 (4)

BQ.1.1.14 (1)

BQ.1.1.15 (3)

BQ.1.1.16 (1)

BQ.1.1.18 (17)

BQ.1.1.21 (1)

BQ.1.1.22 (4)

BQ.1.1.23 (8)

BQ.1.1.25 (2)

BQ.1.1.28 (5)

BQ.1.1.29 (14)

BQ.1.1.3 (2)

BQ.1.1.30 (1)

BQ.1.1.31 (2)

BQ.1.1.32 (34)

BQ.1.1.4 (6)

BQ.1.1.47 (1)

BQ.1.1.5 (4)

BQ.1.1.52 (1)

BQ.1.1.58 (1)

BQ.1.1.6 (1)

BQ.1.1.66 (1)

BQ.1.1.8 (1)

BQ.1.10 (10)

BQ.1.10.1 (1)

BQ.1.11 (2)

BQ.1.12 (12)

BQ.1.13.1 (9)

BQ.1.18 (8)

BQ.1.23 (6)

BQ.1.25 (3)

BQ.1.3 (1)

BQ.1.5 (4)

BQ.1.8 (2)

C.29 (1)

C.36 (2)

C.36.3 (2)

C.37 (1)

CA.3 (1)

CA.7 (1)

CH.1 (1)

CH.1.1 (12)

CH.1.1.1 (26)

CH.1.1.10 (1)

CH.1.1.11 (4)

CH.1.1.2 (2)

CH.1.1.3 (33)

CJ.1 (2)

CK.1 (3)

CK.2 (1)

CK.2.1.1 (2)

CL.1 (9)

CL.1.2 (1)

CL.1.3 (1)

CM.8.1 (2)

CN.1 (2)

CP.1 (1)

CR.1 (1)

DJ.1.1 (1)

DN.1 (1)

DR.1 (1)

DS.1 (2)

DU.1 (2)

DY.2 (1)

DY.4 (1)

EF.1.1 (2)

EG.1 (62)

EK.3 (1)

EL.1 (7)

EM.1 (1)

EP.1 (1)

EU.1.1 (9)

EY.1 (2)

FD.1.1 (1)

FD.2 (1)

FE.1 (11)

FG.2 (3)

P.1 (6)

P.1.14 (1)

P.1.16 (1)

XAF (2)

XAM (1)

XB (1)

XBB (3)

XBB.1 (28)

XBB.1.1 (1)

XBB.1.11.1 (4)

XBB.1.13 (2)

XBB.1.14 (1)

XBB.1.15 (5)

XBB.1.16 (44)

XBB.1.16.1 (20)

XBB.1.17.1 (21)

XBB.1.17.2 (1)

XBB.1.18.1 (2)

XBB.1.19.1 (4)

XBB.1.22 (5)

XBB.1.22.1 (9)

XBB.1.22.2 (5)

XBB.1.24 (1)

XBB.1.28 (1)

XBB.1.4 (8)

XBB.1.4.1 (1)

XBB.1.5 (395)

XBB.1.5.1 (4)

XBB.1.5.11 (4)

XBB.1.5.12 (23)

XBB.1.5.13 (24)

XBB.1.5.14 (3)

XBB.1.5.15 (11)

XBB.1.5.16 (7)

XBB.1.5.17 (8)

XBB.1.5.18 (3)

XBB.1.5.2 (1)

XBB.1.5.20 (6)

XBB.1.5.21 (3)

XBB.1.5.23 (7)

XBB.1.5.24 (12)

XBB.1.5.25 (3)

XBB.1.5.28 (2)

XBB.1.5.30 (1)

XBB.1.5.32 (1)

XBB.1.5.33 (3)

XBB.1.5.35 (6)

XBB.1.5.37 (20)

XBB.1.5.38 (11)

XBB.1.5.4 (2)

XBB.1.5.5 (2)

XBB.1.5.6 (1)

XBB.1.5.7 (17)

XBB.1.5.8 (1)

XBB.1.9 (3)

XBB.1.9.1 (211)

XBB.1.9.2 (59)

XBB.1.9.3 (3)

XBB.1.9.5 (2)

XBB.2 (4)

XBB.2.3 (21)

XBB.2.3.2 (4)

XBB.2.4 (2)

XBB.2.6 (3)

XBB.2.8 (1)

XBB.3 (2)

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XBF.2 (1)

XBF.3 (2)

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XBS (1)

XBT (1)

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"George Sourvinos et al (1)

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"N’Faly Magassouba et al (1)

21549 et al (1)

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Abay Sisay et al (1)

Abdul Karim sesay et al (4)

Abdulla Bashein et al (1)

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Adelaide Milani et al (7)

Ae Kyung Park et al (3)

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Aisling Richmond et al (3)

Akane Negishi et al (12)

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AlSafar et al. (1)

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Ali Maleki et al (2)

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Alla Mironenko et al (2)

Alvarez M et al (1)

Alwasti et al (2)

Ana Gual-de-Torrella et al (1)

Ana da Silva Filipe et al (4)

Anastasia Chatzidimitriou et al. (3)

Andert Rosingh et al. (2)

Andrea Patrizia Salzmann et al (2)

Andreas Henschel et al (1)

Andres Carrazco-Montalvo* et al (6)

Andrey Komissarov et al (60)

Angel Balmaseda et al (1)

Angela Maria Di Pierro et al (2)

Anges Yadouleton et al (1)

Anir Enkhbat et al (1)

Anke Wienecke-Baldacchino et al (3)

Anna Kaliňáková et al (1)

Anna S. Gladkikh et al (1)

Anna-Malin Linde et al (5)

Anne Lavergne et al (5)

Anne-Sophie Logist et al (5)

Annika Ohlsson et al (7)

Anthony Fries et al (3)

Antoine Bridier-Nahmias et al (2)

Antoine Dara et al (2)

Antonin Bal et al (24)

Antonio Grimaldi Patrizia Annunziata Francesco Panariello Claudia Tiberio Tonya Fusco Maria Grazia Foti Valentina Bouche Chiara Colantuono Lucio Di Filippo Anna Manfredi Marcello Salvi Antonio Limone Luigi Atripaldi Andrea Ballabio Davide Cacchiarelli et al (1)

Antonio Grimaldi Patrizia Annunziata Francesco Panariello Claudia Tiberio Tonya Fusco Valentina Bouche Chiara Colantuono Lucio Di Filippo Anna Manfredi Marcello Salvi Emilia Vaccaro Antonio Limone Luigi Atripaldi Andrea Ballabio Davide Cacchiarelli et al (1)

Antonio Grimaldi Patrizia Annunziata Francesco Panariello Claudia TiberioTonya Fusco Michela Daniele Valentina Bouche Ilaria Cimmino Chiara Colantuono Lucio Di Filippo Anna Manfredi Marcello Salvi Antonio Limone Luigi Atripaldi Andrea Ballabio Davide Cacchiarelli et al (1)

Antonio Grimaldi Tonya Fusco Patrizia Annunziata Francesco Panariello Valentina Bouche Chiara Colantuono Mariarosaria Granata Angela Sorrentino Antonio Sorrentino Anna Manfredi Marcello Salvi Giuseppe Portella Andrea Ballabio Davide Cacchiarelli et al (1)

Antonio Grimaldi et al (1)

Antonio Mori et al (1)

Antonio Orduña-Domingo et al (6)

Antonio Rezusta López et al (1)

Aoife Warde et al (1)

Argudin Reguiero Maria De Los Angeles et al (13)

Arie Ardiansyah Nugraha et al (6)

Aristide Berenger Ako AKO et al (1)

Arnott A. et al (3)

Arsen Arakelyan et al (1)

Atsbeha G Weldemariam et al (1)

Aubree Gordon et al (3)

Aurel Allabi et al (2)

Azzania Fibriani et al (1)

BRC: Fatiha M. Benslimane et al (2)

Baker et al (1)

Barbara Skórczewska et al (2)

Bas B Oude Munnink et al (2)

Bas Oude Munnink et al (4)

Baumeister E. et al (2)

Baya Hedjal et al (1)

Bayasgalan Namuutsetseg et al (1)

Beata Rozwadowska et al (14)

Belén Prado-Vivar et al (1)

Benny Yeo et al (10)

Bharti Malhotra et al (6)

Bianca Bruzzone et al (2)

Bin Wang et al (1)

Björn Hallström et al (5)

Blaschitz M. et al (17)

Bleret Léonore et al (1)

Bo Min Lee et al (1)

Bode Shobayo et al (1)

Boniotti Maria Beatrice et al (1)

Borges et al (7)

Brenno V Martins Henrique et al (4)

Brona Brejova et al (1)

Broňa Brejová et al (1)

Bruno A. R. et al (2)

Bruzzone Bianca et al (6)

Bueno Jessica et al (1)

Bulemba Katende et al (1)

Buss E et al (2)

Buss et al (1)

Caitlin Selway et al (5)

Calum Walsh et al (1)

Calvin Sjaarda et al (1)

Carlos Padilla Rojas et al (6)

Carlos Rampersad on behalf of CARPHA et al (8)

Carlotta Olivero et al (4)

Carmen Cherciu et al (1)

Carmen Ezpeleta Baquedano et al (1)

Carmen González et al (4)

Castro et al (4)

Catalina Pascu et al (5)

Catherine Anscombe et al (1)

Catherine Dempsey et al (9)

Catherine E. Arnold et al (1)

Catherine Moore et al (7)

Cecilia Salazar et al (1)

Cedro-Tanda A et al (8)

Chaitanya G. Joshi et al (2)

Chan Chia Jui et al (3)

Chandima Jeewandara et al (2)

Chang Zhang et al (1)

Chantal Akoua-Koffi et al (1)

Chantal Dewinter et al (2)

Chantal Vogels et al (1)

Chaoran Chen et al (5)

Charlotte Michel et al (11)

Chau Vu Pham Hong et al (1)

Chhorvann CHHEA et al (2)

Chilima BZ et al (1)

Chonticha Klungthong et al (3)

Christian Beisel et al (5)

Christian Utpatel et al (1)

Christophe Rodriguez et al (5)

Claudia Gonzalez et al (3)

Claudia Tiberio et al (1)

Collins M. Morang'a et al (3)

Connor et al (1)

Constanza Campano et al (2)

Corina Casangiu et al (4)

Cortinas et al (4)

Cristina Andrés et al (3)

Csaba István Pereszlényi et al (4)

D. Fathmath Nazla Rafeeq et al (2)

D.Keckarević et al (1)

Dakota Howard et al (7)

Danijela Vujošević et al (6)

Danish Covid-19 Genome Consortium et al (21)

David Bante et al (1)

David Perera et al (1)

Dawei Gao et al (1)

Department of Microbiology et al (1)

Di Gaudio F. et al (1)

Djordjevic V. et al (2)

Dorota Kujawa et al (1)

Dovile Ezerskyte et al (1)

Dr Essomba Rene Ghislain et al (2)

Dr Ndodo Nnaemeka et al (1)

Dr Rajesh Karyakarte et al (1)

Dr Runa Jha et al (4)

Dr. Milza Abdul Muhsin et al (1)

Dr. Rame Hamdi khasawneh et al (1)

Dr. Runa Jha et al (2)

Dr. Varsha Potdar et al (3)

Dra. Guadalupe Rodríguez-Rodríguez et al (1)

EL Hamouchi Adil et al (2)

Eberhardt et al (1)

Eduardo Lagarejos González Laura Floren Zabala Ana Bordes Benítez et al (1)

Elaine M. Kenny et al (7)

Elham Rizgalla et al (1)

Elian Terpo et al (2)

Elizabeth Batty et al (1)

Elzbieta Justynska et al (5)

Emma Arvidsson et al (2)

Emmanouil Athanasiadis et al (3)

Emmi Andersson et al (21)

Enatha Mukantwari et al (1)

Endre Gábor Tóth et al (1)

Eric Brown et al (5)

Erika Lindh et al (5)

Eriko Kimura et al (1)

Esdenka Pérez et al (1)

EunJung Lee et al (2)

Everatt J et al (3)

Fabio Miyajima et al (2)

Fabio Tramuto et al (3)

Fajar Nur Sulistyahadi et al (1)

Fatma Bayrakdar et al (2)

Fayez Khardine et al (1)

Felix KOUKOUIKILA-KOUSSOUNDA et al (1)

Fernanda Zurita et al (1)

Fernando Antonio Vinhal dos Santos et al (1)

Fernando Lázaro et al (1)

Ferruccio Ceriotti et al (2)

Filipe Rego et al (5)

Flavio De Maio et al (1)

Florian Juszczak et al (1)

Francesca Greco et al (1)

Francisco Duarte et al (12)

Francisco Gerardo M. Polotan et al (2)

François Dufrasne et al (4)

Freyja Valsdottir et al (4)

GROLHIER Claire et al (1)

Gabriela Rutkowska et al (1)

Geert Martens et al (14)

Georgi Merhi et al (4)

Gergő Túri et al (2)

Ghassan Dbaibo et al (1)

Ghislain ER et al (1)

Giada Rossini et al (3)

Giandhari J et al (1)

Gilliard Nicolas et al (2)

Giorgi Gogoladze et al (1)

Giorgi Tomashvili et al (4)

Giorgio Dirani et al (6)

Githinji G. et al (15)

Giuseppe Viglietto et al (1)

Gkikas Magiorkinis et al (2)

Goletic S et al (2)

Goletic T et al (1)

Gonzalez Claudia et al (1)

Gorova V et al (2)

Grace Ngan et al (4)

Guerrino Macori et al (1)

Hailiang Qi et al (1)

Hajar Lemriss et al (1)

Hakima Kabbaj et al (1)

Hammer et al (1)

Hana Apsari Pawestri et al (1)

Harsha Pulleri Kandi et al (1)

Hartanti Dian Ikawati et al (1)

Haruka Abe et al (2)

Hassan Ihazmade et al (2)

Havid Setyawan et al (1)

Hege Vangstein Aamot et al (1)

Heidi Lindback et al (1)

Helena Jirincova et al (26)

Hervé Albéric Adje Kadjo et al (2)

Hidayat Trimarsanto et al (2)

Hijano Villegas et al (6)

Hubert Niesters et al (1)

Huey-Pin Tsai et al (1)

Hyunsoo Kim et al (1)

Idabely Betancur Ortiz et al (1)

Iglesias-Caballero et al (2)

Ilona Kowalczyk et al (2)

Indira Martins et al (1)

Inmaculada Gómez González et al (1)

Irena Tabain et al (29)

Irene Bianconi et al (1)

Iryna Demchyshyna et al (20)

Isaac Miguel Sánchez et al (3)

Isaac Sanchez et al (1)

Issa Abu-Dayyeh et al (1)

Ivan Topolsky et al (2)

Iyaloo Konstantinus et al (4)

J. Alexander Chitty et al (2)

Jaco J. Verweij et al (1)

Jacob Afelskie et al (3)

Jan Albert et al (6)

Janssens Louise et al (1)

Jaroslaw Paciorek et al (2)

Jasmina Vranes et al (2)

Javier Tognarelli et al (2)

Jean Ruelle et al (1)

Jeong-Ah Kim et al (6)

Jeong-Min Kim et al (2)

Jernej Kovač et al (1)

Jessica Karlsson et al (1)

Jiang et al (1)

Jilini et al (1)

Jing Zhang et al (1)

Joan Marti-Carreras et al (2)

Joel Hassan G. Tolentino et al (4)

Johan Frans et al (11)

Johana Hernandez Toloza et al (1)

John Kayiwa et al (3)

Jose Sanchez-Morgado et al (1)

Joseph Francis Wamala et al (2)

Jozef Dingemans et al. on behalf of the Jessa_cmdLab et al (5)

Juan José Guadalupe et al (1)

Julio Elias Alvarado-Yaah et al (2)

Junsong Zhang et al (1)

Justine Latour et al (2)

K Sadeghi et al (2)

KEITA Mamadou Bhoye et al (1)

Kabengele keith Siame et al (2)

Kalyanasundram J et al (1)

Kamau J et al (1)

Katherine Laiton-Donato et al (6)

Kathrine Stene-Johansen et al (14)

Katya Levytskyi et al (3)

Kefentse Arnold Tumedi et al (1)

Keisha Francis et al (4)

Keith Durkin et al (11)

Keith Robison et al (1)

Kelvin K.W. To et al (1)

Kevin Sanders et al (3)

Kimberly Mahieu et al (11)

Knezevic et al (1)

Koncan R et al (5)

Krasnov et al (1)

Krishna Khairnar et al. (1)

Kristina Borsova et al (2)

Krylova N.V. et al (2)

Kumbu et al (2)

Kwabena O. Duedu et al (1)

Kyriaki Tryfinopoulou et al (5)

Laise de Moraes et al (1)

Latour J. et al (1)

Laura Murillo et al (1)

Laura Vanstraelen et al. on behalf of the Jessa_cmdLab et al (1)

Laura Verdurme et al (1)

Lea Stauber et al (14)

Leakhena Pum et al (2)

Leonore Bleret et al (1)

Leontina Banica et al (3)

Lesly Nyinkeu Kemamen et al (3)

Li Xiaoyan et al (1)

Lin Qi et al (1)

Lippert K. et al (1)

Lobreglio G. et al (1)

Loder et al (1)

Logan J. Voegtly et al (1)

Lorena Robles-Fonseca et al (3)

Lorusso A et al (7)

Lukas Endler et al (5)

Lukas Zemaitis et al (8)

Lydia V. Panggalo et al (1)

Léa Avon et al (43)

M.Tukalo et al. (2)

Madina Tleubergenova et al (1)

Mahamoud Hussein et al (1)

Mahsa Tavakoli et al (1)

Mak TM et al (2)

Malavanh Vongsouvath et al (1)

Manila Souksavanh et al (2)

Manjur Hossain Khan et al (1)

Manraj SS et al (1)

Maphalala G et al (2)

Maponga T et al (2)

Marek Korencak et al (1)

Marhoon et al (6)

Mariane Talon de Menezes et al (1)

Marie Le Mercier et al (1)

Mariela Guajardo et al (11)

Marijke Reynders et al (1)

Marimon JM et al (3)

Marina Simón Páez et al (2)

Marion Barbet et al (15)

Marlena Stadtmüller et al (1)

Martin Kolisko et al (1)

Martinetti Lucchini Gladys et al (61)

Marzena Baranowska et al (7)

María Aroca-Ferri et al (2)

María José Ortega et al (1)

María Lara on behalf of SARS-CoV-2 whole genome sequencing circuit of Andalusia et al (6)

Massab Umair et al (3)

Massimo Dell'Edera et al (3)

Matt Storey et al (1)

Matthijs Welkers et al (5)

Maximilian Riess et al (4)

May-Linh Truong et al (9)

McHugh M et al (1)

Md. Saddam Hossain et al (1)

Megumi Ueno et al (1)

Mencacci A et al (2)

Mendoza L et al (18)

Meri Pantsulaia et al (1)

Mfoutou Mapanguy Claujens Chastel et al (2)

Mhalla Salma et al (1)

Michael Carr et al (4)

Michael Zody et al (1)

Mihaela Leustean et al (2)

Mikhaylov et al (2)

Milada Dvořáčková et al (1)

Mitzi Castro et al (1)

Mohammad Jubair et al (1)

Molalegne Bitew et al (2)

Mona Holberg-Petersen et al (2)

Morais J et al (1)

Mosé Favarato et al (1)

Mounerou SALOU et al (1)

Moustapha Nzamba Maloum et al (1)

Mvula B et al (1)

Myat Htut Nyunt et al (6)

Mélanie Albert et al (1)

Mélnie Albert et al (1)

Nada M. Melhem et al (2)

Nadia Rodrigues et al (1)

Nadia Wohlwend et al (3)

Nagy et al (2)

Naobumi Sasaki et al (1)

Naranzul Tsedenbal et al (2)

Natalie Prystajecky et al (8)

National Public Health Laboratory Team et al (1)

Neta Zuckerman et al (4)

Nguyen Van Vinh Chau et al (1)

Ni Nyoman Ayu Dewi et al (1)

Nicolas M'Nemosyme et al (4)

Nicoletta Medaina et al (1)

Nikhella Winter on behalf of CARPHA et al (4)

Nikita S. D. Sahadeo et al (14)

Nindya Rizqy Kusumawardhani et al (1)

Nir Rainy et al (5)

Norosoa Razanajatovo et al (2)

N’Faly Magassouba et al (1)

Olawoye et al (1)

Oleg V. Pyankov et al (2)

Olga Burduniuc et al (1)

Oluniyi P.E. et al (1)

Omar Alvaro Orellana Diaz et al (1)

Omar Elahmer-Abdulla Bashein- Rahma Algheriani-Ahlam Alarif et al (1)

Orlowska Anna et al (1)

PHE Covid Sequencing Team et al (5)

Pablo Guridi Fernández et al (1)

Pablo Tsukayama et al (2)

Palumbo M et al (2)

Pamela O'Brien et al (11)

Pan et al (1)

Paola Resende et al (10)

Paola Stefanelli et al (1)

Parisi A. et al (1)

Park Inji et al (1)

Pascal Schläpfer et al (99)

Pascale Hilbert et al (1)

PathWest Laboratory Medicine WA Microbial Surveillance Unit et al (2)

Patrick Delly et al (1)

Pavitra Roychoudhury et al (1)

Perez-Castro S et al (2)

Peter Bauer et al (1)

Peter Menzel et al (4)

Pham Ngoc Thach et al (3)

Phuong Truong et al (1)

Pierlanfranco D'Agaro et al (1)

Pilailuk Okada et al (11)

Placide Mbala-Kingebeni et al (4)

Polster E. et al (11)

Ponce-Alonso M et al (2)

Posselt S. et al (6)

Pradip Gyanwali et al (1)

Pramod Kumar et al (1)

Prof. Dr. Achim Kaasch et al (1)

Proietti A et al (1)

Prystajecky Natalie et al (1)

Qiang Sun et al (1)

Quaneeta Mohktar et al (2)

RCGEB - MASA et al (1)

Rabeh El-Shesheny et al (2)

Radosław Charkiewicz et al (1)

Rahman Jamal et al (1)

Raima Sen et al (1)

Ramuth M et al (7)

Ranjit Sah et al (1)

Reinis Vangravs et al (4)

Rendon M et al (1)

Richard Njouom et al (1)

Riva E. et al (1)

Roberto Melendez et al (1)

Rome Buathong et al (2)

Rosette Demar Calixte et al (1)

Rossana C Jaspe et al (5)

Ruth Ann Luna et al (2)

Ruth C Vasquez C et al (1)

Ruth Vasquez et al (1)

SEARCH Alliance San Diego with Jonathan Gonzalez Garcia et al (1)

SEARCH Alliance with Jassim Mohammed Abdo et al (2)

Sabir A Adoub et al (2)

Sabrina Lombino et al (1)

Saenko V.V. et al (2)

Salome Hosch et al (2)

Samar Ben Halima et al (3)

Samiha Al Kharusi et al (1)

Samoilov A.E. et al (8)

Samoilov AE et al (2)

Samuel Cordey et al (117)

Samuel O. Oyola et al (1)

Samuel Sorie et al (1)

Sanders Kevin et al (4)

Sandoval M et al (7)

Sandra Gonzalez et al (1)

Sandra González et al (2)

Sandra Janezic et al (27)

Sandrine Moreira et al (4)

Santoro A. et al (2)

Sara Caucci et al (1)

Sara Marti et al (1)

Sarah Cockerton et al (4)

Seemann et al (4)

Selvavinayagam Sivaprakasam et al (1)

Seon Do Hwang et al (1)

Seong Hee Oh et al (1)

Sergio Aguilar Martínez et al (1)

Sergio Buenestado Serrano et al (3)

Sergio Maria Ivano Malandrin et al (1)

Sero et al (1)

Severine Berden et al. on behalf of the Jessa_cmdLab et al (1)

Shiva Rawat et al (1)

Shtayeh Issa et al (2)

Sidi mohamed Ahmed et al (1)

Sikhulile Moyo et al (3)

Simplice SOMBOT NDICKY et al (1)

Singh et al (1)

Sofia Viegas et al (5)

Solène Grayo et al (1)

Souissi et al (1)

Steev Loyola et al (1)

Stefan Green et al (1)

Stefan Neuenschwander et al (30)

Stephan Kemeny et al (2)

Sui-Yuan Chang et al (1)

Sukithar Rajan et al (2)

Sumonmal Uttayamakul et al (2)

Sundqvist M et al (5)

Sungdo Park et al (4)

Suppiah J et al (1)

Sylwia Krzetowska et al (8)

Tatiana Sedláčková et al (2)

Teemu Smura et al (1)

Teodora Buzharova et al (3)

Thais Silva et al (1)

Thanh Le Viet et al (1)

Thibaut Armel Cherif GNIMADI et al (2)

Thomas Demuyser et al (4)

Thonglakhone XAYBOUNSOU et al (5)

Thornburg et al (1)

Tom Koritnik et al (1)

Tomáš Szemes et al (13)

Tonney Nyirenda et al (1)

Tony Wawina-Bokalanga et al (24)

Trestan Pillonel et al (39)

Trinh Hoang Long et al (1)

Tsuyoshi Sekizuka et al A (1)

Tsuyoshi Sekizuka et al B (2)

Tze Minn Mak et al (1)

Ulrike Protzer et al (1)

Valentina Djordjevic et al (8)

Valeria Micheli et al (1)

Van Rooyen G et al (1)

Verena Kufner et al (86)

Verstrepen et al. (3)

Verónica Saludes et al (1)

Victor M Corman et al (5)

Victoria Posner et al (1)

Vidanovic et al (1)

Viktoria Cabanova et al (4)

Vladimir A. Gushchin et al (1)

Vázquez-Morón et al (2)

Wael H. Roshdy et al (6)

Wael H. Roshdy/ Mohamed Kamal / Shymaa s. Ahmed/ Ramy Galal/Nancy el guindy/ Amelia nagiub/salma sayed/ Abd Monaem Adel/Galal Mahmoud/Dalia Ramadan/Rabeh ..R. El/Shesheny/ Mohamed A Ali/Mohamed Hassany et al (1)

Weijun Chen et al (1)

Wendy Brennan et al (4)

Wołkowicz Tomasz et al (2)

Xhevat Jakupi et al (7)

Xiaoyun Ren et al (1)

Xosé Costa et al (1)

Yacouba Sawadogo et al (3)

Yadi Yasir et al (1)

Yadouleton Anges et al (1)

Yang Pan et al (1)

Yannick Gerth et al (1)

Yasir Elferruh et al (1)

Yathrib Al Zakwani et al (2)

Yeinithy Samudio et al (1)

Yesit Bello-Lemus et al (1)

Yichen Ding et al (2)

Yoga Yoliandhi Koto et al (1)

Yoon YoungJu et al (2)

Young-Ran Ha et al (1)

Yu Kie A/P Chem et al (11)

Yu-Chi Lin et al (9)

Yuki Fujinuma et al (1)

Yukinao Hayashi et al (2)

Yusrina et al (1)

Yvan Butera et al (1)

Zainun Zaini et al (4)

Zhang et al A (1)

Zhang et al B (8)

Ziyuan Hou et al (1)

Zoe Yandle et al (29)

Zygimantas Janeliunas et al (1)

[Regional Virus Laboratory et al (3)

et al (1)

Data updated 2023-05-22•••Auspice v2.63.1